ausführen des htm codes pausieren

hallo
ich hab in meiner site einen java script timer eingefügt. währen der timer im hintergrund runterzählt, ist am bildschirm ein bild zu sehen. wenn der timer auf null ist, soll ein html formular erscheinen. das problem ist nun, dass html code der unten im dokument (nach dem timer script) angefügt ist sofort ausgeführt wird, also bevor der timer auf null steht. wie kann ich das verhindern?

der aufbau des codes sieht in etwa so aus:

-anfang timer script
auszuführender befehl nach ablauf des timers. (nur java befehle, weil inerhalb des scriptes)
-ende timer script
html code zum erstellen der tabelle

ich hab mit dem auszuführend befehl im java script eine externe html datei aufgerufen, die den code für die tabelle enthält. nach ablauf des timers wird diese natürlich in einem eigenen fenster geöffnet, (oder im selben geleerten fenster) statt an einem bestimmten punkt im offenen fenster.

danke!

Bitte Quellcode zeigen, sonst kann man nur raten.

Edit:

Falsch gedacht ^^