Da fehlt der Doctype, so ist der IE im Quirks-Mode und hält sich nicht an die Standards, außerdem ist dein Menü nicht sichtbar, wenn JavaScript deaktiviert ist. Das solltest du ändern, JavaScript ist da ungeeignet.
Wozu brauchst du auf dieser Seite für dieses kleine Menü Javascript? Da reicht wirklich ein normales HTML-Menü. Das ist dann wenigstens auch für JEDEN sichtbar
lass am besten mal was von deinen CSS-Files sehen, sonst lässt sich zu dem Problem nich viel sagen.
Internet Explorer macht generell Probleme(je nach Version) auch bei an sich validem (x)html…
Ich wuerd mach unter google Internet Explorer Layout Bugs bzw Fixes suchen, da wirste einiges finden, was dir zukuenftig viel Zeit und Aerger erspart